检察机关在审查起诉阶段，依法告知了被告人孙振云享有的诉讼权利，并依法讯问了被告人，听取了辩护人的意见。兴安盟检察分院起诉指控：被告人孙振云利用担任通辽市科尔沁区委副书记，通辽市经济技术开发区筹备组负责人、管委会副主任，扎鲁特旗委副书记、旗长，扎鲁特旗委书记，通辽市副市长，通辽市委副书记，通辽市人大常委会党组书记、主任，内蒙古自治区农牧业厅党组书记、厅长，内蒙古自治区农牧厅党组书记、厅长等职务便利，为他人谋取利益，或者利用本人职权或者地位形成的便利条件，通过其他国家工作人员职务上的行为，为请托人谋取不正当利益，索取、非法收受他人财物，数额特别巨大；利用担任通辽市副市长职务便利，挪用公款归个人使用，进行营利活动，情节严重；担任扎鲁特旗长、旗委书记期间，滥用职权，致使国家利益遭受特别重大损失，依法应当以受贿罪、挪用公款罪、滥用职权罪追究其刑事责任。